W celu ograniczenia negatywnego wpływu odpadów na środowisko przyrodnicze i populację na terenie Specjalnego Parku Narodowego wprowadza się zakaz sprowadzania, składowania, oraz przewozu odpadów spoza jego terenu. Zakaz ten dotyczy zarówno materiałów niebezpiecznych: chemikalii, środków promieniotwórczych, substancji mutogennych i kancerogennych, metali, opon,a także odpadów organicznych typu odpady pohodowlane, odpadów budowlanych.
Wszystkie odpady generowane na terenie Łyńsko-Zawkrzańskiego Specjalnego Parku Narodowego muszą być utylizowane na jego terenie. Dopuszczalna jest wyłącznie wysyłka metali kolorowych i złomu do punktów odzysku lub hut.
Odpady organiczne powinny być utylizowane w obrębie miejscowości, lub gmin. Jeśli to możliwe powinny służyć do produkcji biogazu lub wodoru.
Tworzywa sztuczne powinny być poddawane recyklingowi na poziomie co najmniej 95%, zalecane jest tworzenie z nich ociepleń, materiałów budowlanych.
W doborze produktów używanych przez indywidualnych odbiorów, jak i instytucje i przedsiębiorców należy brać pod uwagę ślad węglowy ich produkcji, oraz koszty ich utylizacji po zakończeniu użytkowania.
Niedopuszczalne jest tworzenie dużych wysypisk śmieci na terenie Specjalnego Parku Narodowego.